Kondyloma är ofarliga. Virus som förorsakar vårtorna sprider sig inte till de inre organen och därmed påverkas inte möjligheten att få barn. Viruset förhåller sig utanpå slemhinnor och hud och går inte in i blodet. Däremot kan något HPV-virus emellertid ge cellförändringar på livmoderhalsen hos kvinnor. Dessa cellförändringar försvinner som regel av sig självt men kan i vissa fall utvecklas långsamt vidare till cancer.